Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms