Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SelpQ01102 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SelpQ01102 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelpQ01102 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms