Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms