Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp1Q00915 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms