Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms