Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms