Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms