Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cry1P97784 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms