Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme1P97371 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Psme1P97371 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Psme1P97371 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms