Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps3aP97351 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms