Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms