Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctps1P70698 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms