Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad50P70388 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad50P70388 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad50P70388 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms