Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms