Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms