Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NficP70255 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NficP70255 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NficP70255 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NficP70255 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NficP70255 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NficP70255 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms