Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf5P70191 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf5P70191 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms