Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms