Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Vbp1P61759 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Vbp1P61759 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Vbp1P61759 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Vbp1P61759 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Vbp1P61759 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Vbp1P61759 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vbp1P61759 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vbp1P61759 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vbp1P61759 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vbp1P61759 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vbp1P61759 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vbp1P61759 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vbp1P61759 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vbp1P61759 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vbp1P61759 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vbp1P61759 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vbp1P61759 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vbp1P61759 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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