Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms