Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snap25P60879 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms