Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CgnP59242 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CgnP59242 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CgnP59242 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CgnP59242 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CgnP59242 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms