Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms