Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp3P58854 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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