Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms