Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TdgP56581 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TdgP56581 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TdgP56581 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TdgP56581 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TdgP56581 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TdgP56581 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TdgP56581 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TdgP56581 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TdgP56581 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TdgP56581 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms