Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms