Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AgrpP56473 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AgrpP56473 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AgrpP56473 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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