Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms