Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms