Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms