Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms