Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MipP51180 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MipP51180 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MipP51180 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MipP51180 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms