Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Defa10P50708 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa10P50708 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms