Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HpdP49429 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HpdP49429 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HpdP49429 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpdP49429 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms