Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CitP49025 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CitP49025 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CitP49025 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CitP49025 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CitP49025 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CitP49025 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms