Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LmnaP48678 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LmnaP48678 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms