Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VdrP48281 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VdrP48281 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VdrP48281 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VdrP48281 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VdrP48281 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VdrP48281 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VdrP48281 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VdrP48281 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VdrP48281 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VdrP48281 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VdrP48281 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VdrP48281 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VdrP48281 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VdrP48281 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms