Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Epb41P48193 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms