Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms