Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms