Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtlP38585 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtlP38585 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtlP38585 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtlP38585 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms