Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms