Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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