Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpardP35396 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpardP35396 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpardP35396 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PpardP35396 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PpardP35396 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PpardP35396 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PpardP35396 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PpardP35396 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PpardP35396 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PpardP35396 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PpardP35396 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms