Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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