Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk4P30285 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk4P30285 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms