Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms