Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CftrP26361 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CftrP26361 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CftrP26361 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CftrP26361 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CftrP26361 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CftrP26361 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CftrP26361 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CftrP26361 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CftrP26361 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CftrP26361 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CftrP26361 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CftrP26361 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CftrP26361 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CftrP26361 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CftrP26361 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CftrP26361 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CftrP26361 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CftrP26361 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CftrP26361 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CftrP26361 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CftrP26361 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CftrP26361 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CftrP26361 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CftrP26361 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CftrP26361 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CftrP26361 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CftrP26361 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CftrP26361 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CftrP26361 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CftrP26361 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CftrP26361 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms