Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms